财政预算体制改革及新《预算法》、《政府会计准则》的出台,不仅需要事业单位提高会计核算质量,而且还需要建立起内部控制体系以提高财务风险防范能力。而在实际运行中,我国个别事业单位在内控体系建设与财务风险防范中仍存在着诸多问题,亟待我国事业单位建立创新内控、风险防范体系,以确保我国公益事业的顺畅开展。本文将通过对事业单位内控体系与风险防范重要意义以及其存在的问题进行分析,在此基础上,提出创新的事业单位内控和风险防范体系,以及其建立的具体措施。