一例合并外耳发育不良的先天性糖基化障碍1y型患儿的 SSR4基因变异分析

作者：吴若豪; 唐文婷; 邱坤银; 李晓娟; 何展文^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2022, 39(07): 727-730.

• SSR4基因
• 新发变异
• 移码变异
• 先天性糖基化障碍病1y型
• 外耳发育不良

目的探讨1例合并外耳发育不良的先天性糖基化障碍1y型(congenital disorder of glycosylation type 1y, CDG-1y)患儿的遗传学病因。方法采用家系全外显子测序法(trio-whole exome sequencing, trio-WES)检测相关基因的变异, 通过Sanger测序法对候选变异进行验证, 并对其致病性进行生物信息学预测。结果患者为男性, 10岁, 主要表现为智力障碍、小头畸形合并先天性外耳发育不良。trio-WES检测发现患儿携带X染色体SSR4基因第4外显子c.302dupC(p.Y102Lfs*2)半合子移码变异, 既往未见报道。Sanger测序在患儿父母中均未发现同样的变异, 故属于新发变异(de novo)(PS2);在主要人群基因频率数据库中均未收录(PM2)。多种软件预测结果均提示其为致病变异(PP3)。UCSF chimera软件分析提示, 该变异可使SSR4蛋白空间结构严重变形, 导致生物学功能的丧失(PVS1+PM1)。根据ACMG指南, 判断为致病性变异(PVS1+PS2+PM1+PM2+PP3)。结论 SSR4基因c.302dupC(p.Y102Lfs*2)可能为患儿罹患CDG-1y的原因。上述发现拓宽了SSR4基因的变异谱以及CDG-1y的表型谱。

• 单位
  中山大学肿瘤防治中心; 中山大学孙逸仙纪念医院