弧菌科质粒pJV的全序列测定、基因预测及其复制区的鉴定

作者：姜娜; 邢薇; 李铁梁; 罗琳; 闫兵兵; 刘彩霞; 马志宏

来源：黑龙江畜牧兽医, 2016, (23): 18-296.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2016.2272

• 鳗弧菌
• 质粒
• 测序
• 基因预测
• 复制区

为了从条件致病菌鳗弧菌中提取到天然质粒,获得该质粒的全序列,并得到在弧菌中起复制作用的区域,试验采用向上引物和向下引物共9条,双向测通该质粒,经拼接得到质粒p JV的全序列,利用Glimmer3基因预测软件对该质粒可能包含基因模型进行预测和基因注释,通过在线工具OriFinder预测分析该质粒的复制区域,并将该区域克隆到T载体中,验证重组质粒在弧菌科菌种中的复制效果。结果表明:该质粒p JV全长5 982 bp(Gen Bank登录号为JQ782192),有4个含有核糖体结合位点的基因(UQY-2、UQY-3、UQY-4、UQY-6);质粒p JV的复制元件是一段长313 bp的序列(含Dna A boxes)。说明经过试验验证,该片段使T载体具有在维氏气单胞菌中复制的能力,即证明该片段为鳗弧菌质粒p JV的复制区,可用于新弧菌科载体的构建和疫苗研制等。

• 单位
  上海海洋大学; 天津科技大学; 北京市水产科学研究所