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摘要
目的本研究拟用生物信息学方法,对溃疡性结肠炎患者结肠黏膜的基因表达谱数据进行深入挖掘分析,以期筛选潜在的病理机制和治疗靶点。方法基因芯片原始数据来自于GEO公共数据库,编号为GSE65114。共包括12例健康志愿者对照样本和18例溃疡性结肠炎患者样本。原始数据在GCBI分析平台进行处理,首先进行两组间差异基因表达分析,得到的差异基因再进行功能和信号通路富集分析。最后构建信号通路网络和基因共表达网络,筛选核心靶点通路和基因。结果共得到499个显著性差异基因(包括408个上调和91个下调基因),其中排名第一的是SFRP2基因。功能富集分析结果表明,这些差异基因与免疫和炎症反应密切相关。信号通路网络结果显示,Toll样受体通路处在网络核心位置。基因共表达网络中,COL6A3、IRAK3等基因被确定为核心基因。这些核心通路和基因可能在溃疡性结肠炎的病理中发挥重要作用。结论溃疡性结肠炎与炎症和免疫反应密切相关,其中Toll样受体通路和SFRP2、COL6A3、IRAK3等基因可能是溃疡性结肠炎重要的致病因素和潜在的治疗靶点。
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单位中国人民解放军空军军医大学; 武汉市第三医院; 西京医院; 武汉大学
