猪流行性腹泻病毒S2基因的克隆与遗传进化分析

作者：焦文强; 邢广旭; 刘运超; 徐引弟; 王治方; **领; 李海利

来源：山东农业科学, 2020, 52(02): 106-110.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2020.02.019

• 猪流行性腹泻病毒
• S2基因
• 克隆
• 进化分析
• 阳性检出率

为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)新流行毒株的遗传变异情况,本研究对2014—2018年间采集的205份PEDV疑似阳性样品进行RT-PCR检测、扩增PEDV S2基因并进行遗传转化分析。RT-PCR结果显示,205份疑似阳性样品中有191份扩增出单一条带,片段大小为1 887 bp,符合S2基因的扩增预期。试验样品阳性检出率为93. 17%。测序分析表明,试验共获得25株S2基因序列,与参考毒株之间核苷酸的同源性为94. 3%～99. 6%,氨基酸的同源性为86. 4%～96. 2%。遗传进化分析结果显示,试验得到的PEDV毒株分属于G1、G2亚群。本研究为PEDV防控以及疫苗毒株筛选奠定基础。

• 单位
  河南省农业科学院