非小细胞肺癌放疗敏感性miRNAs的生物信息学筛选

作者：陈旭; 徐燕梅; 张露萍; 李德志; 孙建国

来源：中华肺部疾病杂志(电子版), 2016, 9(02): 131-134.

• 非小细胞肺癌
• 基因芯片
• 生物信息学
• 放疗敏感性
• miRNAs

目的利用基因芯片及生物信息学方法预测与非小细胞肺癌(NSCLC)放疗敏感性相关的miRNAs。方法检索GEO数据库,获取H460、H1299细胞株经2Gy电离辐射后随时间变化的基因表达谱,经组织特异性分析、功能富集(GO)分析、信号转导通路(Pathway)分析、miRNAs预测分析、转录因子(TF)分析,并建立mRNA-miRNA-TF网络,获取NSCLC放疗敏感性相关的miRNAs。结果获得了NSCLC放疗敏感性基因表达谱,辐射抵抗潜在基因共23个,辐射敏感潜在基因共97个;与放疗敏感性相关的miRNAs共19个,其中调控辐射抵抗组的miRNAs共14个:hsa-miR-1-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-153-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-206、hsa-miR-302e、hsa-miR-328-3p、hsa-miR-372-3p、hsa-miR-495-3p、hsa-miR-520a-3p、hsa-miR-520b、hsa-miR-520d-3p、hsa-miR-520e、hsa-miR-613;调控辐射敏感组的miRNAs共5个:hsa-let-7c-5p、hsa-miR-137、hsa-miR-203a-3p、hsa-miR-34c-5p、hsa-miR-98-5p。结论利用生物信息学方法初步筛选到与非小细胞肺癌放疗敏感性相关的miRNAs。

• 单位
  乐山市人民医院; 第三军医大学新桥医院