甘蓝型油菜转录因子SRS基因家族的全基因组鉴定及表达分析

作者：王龙; 张永顺; 王红艳; 肖麓^*

来源：中国油料作物学报, 2023, 1-13.

DOI：10.19802/j.issn.1007-9084.2023007

• SRS
• 基因家族
• 进化
• 转录组
• 甘蓝型油菜

SRS(shi-related sequence)是植物特异的转录因子家族，在植物生长发育、激素信号转导和应对胁迫响应过程中发挥着重要的作用。为了研究SRS基因家族在甘蓝型油菜（Brassica napus L.）中潜在的生物学功能以及该基因家族在甘蓝型油菜形成过程中的进化，利用比较基因组学的方法，在甘蓝型油菜及二倍体祖先种白菜（B. rapa L.）和甘蓝（B. oleracea L.）中分别鉴定到38、16和20个SRS基因，并对其理化性质、系统发育关系、基因结构、基因共线性、顺式作用元件和表达模式进行分析。结果表明，所有鉴定的SRS蛋白被分为9个分支，且甘蓝型油菜SRS基因家族的进化过程中发生了内含子/外显子的丢失事件。Ka/Ks分析发现，SRS基因在重复事件后经历了纯化选择。在多数的SRS基因启动子中发现了分别与光响应、厌氧诱导和脱落酸响应相关的顺式作用元件，且甘蓝型油菜SRS基因启动子比二倍体祖先启动子含有更多的胚乳基因表达和光响应顺式作用元件。转录组分析发现，甘蓝型油菜SRS基因在不同处理下以不同的表达模式响应并表现出根部的优势表达。综上，本研究为了解甘蓝型油菜SRS基因家族功能和作用提供初步的理论依据，为甘蓝型油菜及其二倍体祖先之间基因进化的分子机制提供参考。

• 单位
  辽宁大学; 青海大学