组蛋白去乙酰化酶抑制剂影响的代谢相关基因的组学筛查及验证

作者:曹继红; 廖尉廷; 沃琤; 徐国荣; 徐焕新; 李平龙; 陶冶; 王鹏; 林加日; 邓连瑞
来源:遗传, 2015, 37(09): 918-925.
DOI:10.16288/j.yczz.15-128

摘要

组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)催化组蛋白去乙酰化,与细胞增殖、分化及凋亡等诸多过程密切相关。HDAC抑制剂(HADC inhibitors,HADCIs)具有潜在的抗肿瘤作用,是近年药物筛查的热点之一。近期研究提示HDAC2可通过影响细胞代谢过程发挥抗肿瘤作用,但各类HDACIs调控代谢过程的机制尚待研究。本研究以肝细胞系(Hep G2)为研究对象,整合比较了两种HDACIs(TSA和SAHA)的表达谱数据。在TSA处理组中,筛查到380个差异表达基因(DEGs)及35个DEGs富集的KEGG通路;SAHA处理组的表达分析印证了大多数DEGs(177/380)和富集通路(23/35)。比较分析发现,在这两类HDACIs共同影响的通路中,近一半通路(9/23)与代谢有关;近1/3共享DEGs(66/177)参与代谢过程。通过HDAC2 si RNA细胞实验证实了TSA和SAHA对代谢基因的影响。本研究结果显示HDACIs在治疗肿瘤等代谢性疾病方面具有潜在的应用价值。

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