摘要
查尔酮异构酶是花青素生物合成上游途径的一个关键酶。为研究马铃薯StCHI基因的结构及功能,基于紫色马铃薯品系‘15-12-16’和白色马铃薯品种“下寨65”的转录组数据,利用RT-PCR技术在马铃薯品系“15-12-16”中克隆得到StCHI,并进行了生物信息学分析。利用qRT-PCR技术分析StCHI基因在“15-12-16”不同组织根、茎、叶、花瓣、薯皮、薯肉中的表达水平。结果表明:StCHI基因的CDS为633 bp,该基因编码210个氨基酸,蛋白分子量为23.852 kDa,理论等电点(pI)为4.75,脂溶性指数为91.81,为不稳定的亲水性蛋白。亚细胞定位预测该基因在叶绿体中。蛋白信号肽预测StCHI基因编码的蛋白质为非分泌蛋白,无信号肽,无切割位点。通过同源蛋白多序列比对及进化树分析发现,该基因与风铃辣椒、黄辣椒、黄果枸杞等同一茄科的物种亲缘关系较近,相似度分别为92.31%、91.83%、90.43%。通过实时荧光定量分析发现,该基因在“15-12-16”的各组织中都有所表达,并且该基因具有组织特异性,在花瓣中的表达量较高。为深入研究马铃薯的花青素生物合成提供坚实的理论基础,同时为培育彩色马铃薯以及提取天然色素提供参考价值。。
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