捻转血矛线虫阿苯达唑耐药株给药前后比较转录组学分析

作者：赵学亮; 王姝懿; 呼和巴特尔; 孙柯; 苏倩; 吕旭; 王文龙^*; 刘春霞^*

来源：畜牧兽医学报, 2019, 50(03): 637-644.

• 捻转血矛线虫
• 阿苯达唑
• 耐药性
• 转录组

为探明捻转血矛线虫阿苯达唑耐药株给药前后在转录组水平上的差异,本研究采用Illumina Hiseq4000对给药前后的捻转血矛线虫进行转录组测序,筛选得到差异表达基因并通过GO和KEGG数据库对其进行功能注释及富集性分析,并利用荧光定量PCR验证部分差异表达基因。结果显示,共筛选获得851个显著差异表达基因,其中包括584个上调基因和267个下调基因。通过GO功能富集分析显示,有458、418和367个基因分别注释到生物学过程、分子功能和细胞组分三大类;对差异表达基因进行KEGG富集分析显示,有173个差异表达基因参与到75条KEGG通路中,显著富集在核糖体合成、细胞凋亡、过氧化物酶增殖体激活受体(PPAR)等信号通路。本试验初步筛选了阿苯达唑耐药株给药前后的差异表达基因,为深入探索捻转血矛线虫耐药性分子机制、筛选对耐药性检测的分子标记及耐药性早期鉴别诊断方法的建立提供重要数据。

• 单位
  内蒙古自治区综合疾病预防控制中心; 内蒙古农业大学; 农业部