印度橄蝗线粒体基因组测定及系统发育分析

作者：邱忠营; 黄原; 茹凝玉; 崔媛媛

来源：广西林业科学, 2020, 49(04): 471-479.

DOI：10.19692/j.cnki.gfs.2020.04.001

• 线粒体基因组
• 印度橄蝗
• 瘤锥蝗科

从分子水平分析印度橄蝗(Tagasta indica)与近缘昆虫的系统发生关系,采用一代PCR测序方法对印度橄蝗的线粒体基因组进行测序,对序列进行拼接、注释和特征分析,并利用线粒体基因组的13个蛋白编码基因(PCGs)和2个核糖体RNA(r RNAs)构建贝叶斯(BI)树。结果表明,印度橄蝗的线粒体基因组长度为15 531 bp,包括13个PCGs、22个转运RNA(t RNAs)、2个r RNAs和1个控制区;线粒体基因排列紧凑,基因排序与祖先序列相同。线粒体蛋白编码基因中,除nad2、cox1和nad6为非标准起始密码子GTG、ACT和TTG外,其余均为标准起始密码子ATN;终止密码子中,除cox3为不完全终止密码子TA外,其余均为完整终止密码子TAA或TAG。线粒体的22个t RNAs中,除trn SAGN缺少DHU臂外,其余均为典型三叶草结构。错配方式主要为G-U错配。构建的贝叶斯树支持瘤锥蝗科(Chrotogonidae)的单系性。

• 单位
  生命科学学院; 陕西师范大学; 西安医学院