文章对水利工程建设施工供应链中的分包商与总承包商双方合作的质量控制博弈问题进行分析和探讨,并基于施工供应链质量控制构建了收益模型。然后在详细分析了分包商与总承包商控制措施的基础之上建立了质量保证金扣除额度与质量保证水平之间的指数函数关系,其中施工质量保证水平以及质量保证金和质量监督效力分别为分包商、总承包商的控制手段,并对双方的质量博弈策略利用最优控制理论进行探讨。研究表明:本研究所采用的质量保证金扣除方方式以及博弈策略对于促进水利工程建设质量、提高其科学性与有效性具有重要意义。