miR-196a在剑白香猪不同颜色皮肤组织中的表达及靶基因预测

作者：蒙泽飞; 陈伟^*; 陈龙; 杨帅; 刘英渠; 朱红橙; 罗文怡

来源：贵州畜牧兽医, 2023, 47(06): 9-13.

• 剑白香猪
• 皮肤组织
• miR-196a表达
• 靶基因预测

为探究miR-196a在剑白香猪不同颜色皮肤组织中的表达及其靶基因的富集情况，试验采集剑白香猪的白色和黑色皮肤组织，采用qRT-PCR技术检测2种颜色皮肤组织中miR-196a的表达水平，运用MEGA11软件比对分析miR-196a与其他物种间的保守性，通过在线软件PicTar、TargetScan预测其靶基因，利用DAVID数据库对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果：miR-196a在剑白香猪白色皮肤组织中的表达量极显著高于黑色皮肤组织(P<0.01);GO功能分析表明，生物过程、细胞定位、分子功能分别富集于38、13、27个条目；KEGG通路富集分析表明，miR-196a靶基因主要富集于蛋白质消化吸收、癌症miRNAs、黑色素生成等通路，其中黑色素生成通路包括NRAS、ADCY9、CALM3基因。结论：推测miR-196a与剑白香猪皮肤颜色遗传相关。

• 单位
  动物科学学院; 贵州大学