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摘要
青霉素结合蛋白PBP2a是使耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)产生耐药的原因之一,基于该靶点的中药成分虚拟筛选有助于发现中药在治疗细菌耐药的有效物质,因此基于分子对接技术从蒲公英中筛选出可能抗MRSA的天然药物,并初步探讨所筛选活性化合物与PBP2a蛋白相互作用机制。选择PBP2a蛋白3D结构(PDB ID:5M19),用Autodock vina进行分子对接,以原配体苯唑西林打分值为参考进行筛选,在PBP2a蛋白活性位点处,打分值高于原配体的候选化合物共计57个。其中,蒲公英甾醇、异绿原酸A、款冬二醇、羽扇豆醇、齐墩果酸对PBP2a蛋白有较好的结合作用。这5种物质都与ARG151、ARG241氨基酸残基形成氢键作用,且异绿原酸A和齐墩果酸报道有增敏和抑菌作用。实验结果可以为发现新型抗菌药提供理论基础。
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