巴西橡胶树膜结合NAC转录因子HbNTL1的克隆及生物信息学分析

作者：康桂娟; 曾日中; 聂智毅; 代龙军; 段翠芳; 黎瑜

来源：中国农学通报, 2013, 28(31): 7-14.

• 巴西橡胶树
• 膜结合NAC转录因子
• 基因克隆
• 生物信息学分析

根据巴西橡胶树胶乳cDNA文库中筛选到的NAC EST序列,克隆了橡胶树膜结合NAC转录因子,HbNTL1的cDNA和基因组DNA序列。生物信息学分析显示HbNTL1基因包含6个外显子和5个内含子,开放阅读框(ORF)为1704bp,编码了567个氨基酸。HbNTL1编码蛋白的相对分子量为62.52kDa,理论等电点PI为4.62,N-端具有保守的NAC结构域,高度变异的C-端有一个跨膜结构域(TM)。序列比对和系统进化分析表明,HbNTL1蛋白属于NAC转录因子家族中的NAC2亚族,推测其可能与橡胶树生长发育和胁迫应答有关。

• 单位
  农业部; 中国热带农业科学院橡胶研究所