不同浓度维生素D刺激下体外滋养细胞的二代测序研究

作者：徐彤; 马岩团进; 张宇航; 何秋月; 黄薇; 吕梦欣; 唐健; 何建萍; 蒋国庆; 钱源^*

来源：昆明医科大学学报, 2022, 43(10): 1-9.

• 维生素D
• 滋养层细胞
• 差异表达基因

目的 利用二代测序技术筛选维生素D刺激后胎盘滋养细胞中差异表达基因（differential expression gene,DEG），分析其在维生素D缺乏引起的不良妊娠结局发病机制中可能发挥的潜在作用。方法 通过二代测序分析不同浓度的维生素D(0.1、1、10、100 nmol/L)刺激细胞的mRNA表达情况，筛选出DEG，应用GO和KEGG进行富集分析，构建PPI网络筛选中枢基因。结果 4种不同浓度维生素D刺激的细胞样本和未加维生素D刺激的正常对照样本的基因表达情况如下：VitD 0.1 vs Control组共获取了354个DEG，包括242个上调，112个下调；VitD 1 vs Control组共获取了320个DEG，包括216个上调，104个下调；VitD 10 vs Control组共获取了374个DEG，包括277个上调，97个下调；VitD 100 vs Control组共获取了300个DEG，包括151个上调，149个下调。最后对4组DEG取交集，共获得9个共同的DEG。GO分析显示，生物过程主要集中在胶原原纤维组织、细胞分化、细胞趋化、细胞分化的负调控、信号受体活性的调节、细胞外结构组织、细胞外基质的组织、蛋白质分泌，调节的细胞成分富集在胶原三聚体复合物、蛋白质的细胞外基质、细胞的顶端部分、胶原蛋白三聚物，调节的分子功能富集于受体配体活动、受体调节器活动、蛋白质桥接、细胞因子活性。KEGG分析显示在刺激神经组织的受体配体相互作用、细胞粘附分子、胃癌、细胞因子受体相互作用、产生IgA的肠道免疫网络、炎症性肠病、疟疾、阿米巴病和PI3K-Akt信号通路中显著富集。PPI网络确定17个中枢基因（COL1A2、ACTA2、S100A4、TAGLN、CSF1R、TLR4、TNFSF13B、FTCD、APOBEC3G、IL6、IGF1、PDGFRB、TGFB2、BGLAP、COL4A4、COL8A1和COL11A1）。结论 COL1A2、ACTA2、S100A4、TAGLN、CSF1R、TLR4、TNFSF13B、FTCD、APOBEC3G、IL6、IGF1、PDGFRB、TGFB2、BGLAP、COL4A4、COL8A1、COL11A1可能与维生素D缺乏引起的不良妊娠结局的发生、发展相关，也可为维生素D缺乏引起的不良妊娠结局提供潜在的治疗靶点。

• 单位
  昆明医科大学第一附属医院; 昆明市妇幼保健院