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摘要
目的：采用生物信息学方法对肝癌和2型糖尿病的共同差异表达基因进行分析，以揭示肝癌与2型糖尿病之间的潜在病理生理联系。方法：从公共数据库（GEO）下载肝癌与2型糖尿病的基因表达阵列数据，通过R软件对数据进行预处理，获得重叠差异表达基因，进一步利用DAVID和STRING数据库对这些差异基因进行基因富集分析并构建蛋白互作网络。使用在线数据库GEPIA进行生存分析。结果：通过差异基因筛选，我们获得328个重叠差异基因，包括176个共同差异基因以及152个独立差异基因。共同差异基因包括78个上调基因，98个下调基因，独立差异基因包含在糖尿病中下调的82个基因以及在肝癌中下调的70个基因。通过基因富集分析发现，共同差异基因主要富集在DNA损伤以及免疫调控、细胞凋亡等功能，独立差异基因的功能主要富集在有机氮化合物代谢，最后通过以共同差异基因为目标构建蛋白互作网络，获得核心节点蛋白。对核心节点蛋白进行生存分析，得到6个生存相关核心基因。结论：本研究通过生物信息学方法筛选同时与肝癌和2型糖尿病相关的8个核心基因，为研究糖尿病相关肝癌提供靶点参考。
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单位武汉大学中南医院
