基于生物信息学分析RPS19基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义

作者：蔡华裕; 程远航; 王洁; 赵虎; 吴卫真^*

来源：临床泌尿外科杂志, 2019, 34(09): 689-694.

DOI：10.13201/j.issn.1001-1420.2019.09.004

• 肾透明细胞癌
• RPS19
• 数据分析
• 预后

目的:通过生物大数据分析核糖体蛋白S19(RPS19)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及预后意义。方法:利用Oncomine数据库检索并筛选出RPS19的信息,得到RPS19在ccRCC的表达情况,使用GEPIA数据库分析RPS19的表达与ccRCC患者在TCGA数据中生存率之间的关系,采用LinkedOmics数据中的LinkFinder模块分析RPS19与ccRCC临床病理特征的关系。通过LinkedOmics进行RPS19在TCGA KIRC数据中的表达相关性分析,并进一步通过Metascape网站进行基因富集分析。结果:RPS19的表达水平在ccRCC组织中较正常组织明显升高。RPS19的表达与ccRCC的病理分级、T分期、N分期呈显著正相关性。高表达RPS19的患者总体生存率显著低于低表达RPS19的患者。此外,RPS19基因与RPLP2、RPS2、RPS11、PRS15、RPS16、RPS9等基因密切相关,可能通过TNF-α/NF-κB参与ccRCC的发生发展(P<0.001)。结论:RPS19在ccRCC中显著高表达,并与ccRCC的发生发展相关,大大增加其作为潜在治疗靶点的可能性。

• 单位
  厦门大学附属东方医院