熊去氧胆酸应答不佳原发性胆汁性胆管炎女性患者肝组织lncRNA、mRNA差异表达分析

作者：高丽丽; 张亦瑾; 高学松; 李洪杰; 刘楠; 高萍; 段雪飞^*

来源：中国肝脏病杂志(电子版), 2023, 15(02): 47-53.

• 原发性胆汁性胆管炎
• 应答不佳
• 长链非编码RNA

目的 筛选熊去氧胆酸（ursodeoxycholic acid,UDCA）应答不佳原发性胆汁性胆管炎（primary biliary cholangitis,PBC）女性患者肝组织长链非编码RNA(long noncoding ribonucleic acid,lncRNA)、mRNA差异表达基因，并进行生物信息学分析。探讨其在PBC应答不佳中的作用及潜在功能。方法 收集2016年7月至2017年7月首都医科大学附属北京地坛医院6例女性PBC患者的肝组织穿刺标本，其中3例对UDCA应答好（对照组），另外3例对UDCA应答不佳（试验组）。通过RNA提取、纯化、扩增及芯片实验，以差异倍数（fold change,FC）≥1.5倍，P <0.05作为筛选条件，利用Illumina高通量测序技术检测6例PBC患者肝组织中lncRNA、mRNA的表达水平，筛选差异表达的lncRNA和mRNA。对差异表达的LncRNA、mRNA进行基因本体（gene ontology,GO）功能分析、信号转导通路富集分析（kyoto encylopaedia of genes and genomes,KEGG分析）及蛋白互作网络分析，寻找与PBC应答不佳相关的lncRNA。结果 共检测到差异表达的mRNA 599个（312个上调，287个下调）、lncRNA 1167个（685个上调，482个下调）。GO与KEGG分析发现，差异表达的mRNA与甘油三酯、长链脂肪酸代谢、胆固醇排出、糖原异生及正向调节血管生成等相关。而这些mRNA与核受体过氧化物酶体增殖激活受体（peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR）信号通路、转化生长因子β(transforming growth factor beta,TGF-β)信号通路、脂肪酸降解通路、细胞因子受体相互作用信号通路等相关。差异表达lncRNA的靶基因与磷代谢、磷酸盐代谢、能量代谢、细胞活化、免疫效应调节、抗原加工和提呈相关。这些靶基因与病毒感染通路、泛素介导的蛋白降解通路、线粒体自噬通路、细胞因子受体相关通路、Wnt信号通路相关。结论 本研究是PBC应答不佳相关lncRNA谱的补充，研究发现了一定数量差异表达的lncRNA，并预测其功能靶向基因及涉及信号通路，有望为PBC应答不佳研究提供新的参考依据。

• 单位
  首都医科大学附属北京地坛医院