基于SSR标记的芥菜品种鉴定技术体系建立及应用

作者：颜新林; 管中荣; 温雯; 张浙峰; 王晨宇; 沈进娟; 汪启明; 韩瑞玺^*; 饶力群^*

来源：植物遗传资源学报, 2021, 22(03): 758-770.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.20201014002

• 芥菜
• SSR标记
• 品种鉴定
• DNA指纹图谱

利用SSR分子标记建立芥菜品种鉴定体系,旨在为我国芥菜育成品种鉴定提供高通量、快速鉴定方法。选取芥菜16个变种代表性品种用于SSR引物初筛,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从432对引物中筛选出84对条带清晰、稳定性好、多态性高的芥菜SSR引物,并对筛选出的引物5′端进行荧光标记。另外选取96份品种对上述84对引物进行复筛,利用基因分析仪对所有扩增片段大小进行分析,依据各引物的扩增稳定性、峰型易读取程度、多态性及染色体位置等,最终筛选出25对SSR引物作为核心引物,并为其设置参照品种以消除不同试验批次或平台等因素引起的误差。根据荧光颜色和扩增片段大小将25对核心引物分成6组,建立基于SSR标记的芥菜品种鉴定体系。利用该套核心引物构建了189份芥菜品种的DNA指纹数据库,共检测到175个等位变异,平均每对引物检测到7个等位变异;基因多样性指数变化为0.239～0.870,平均为0.555;多态性信息含量在0.23～0.86之间,平均为0.493。本研究建立的基于毛细管电泳平台的芥菜SSR分子标记品种鉴定体系,可用于芥菜品种真实性快速鉴定、遗传多样性分析和DUS测试近似品种辅助筛选等。

• 单位
  四川省农业科学院作物研究所; 湖南农业大学