耐拉米夫定乙型肝炎病毒变异株全基因组克隆及鉴定

作者:邓欣; 李辉; 欧璇; 刘钦; 蒋小玲; 伍欣星
来源:武汉大学学报(医学版), 2006, 27(1): 5-8,16.
DOI:10.3969/j.issn.1671-8852.2006.01.002

摘要

目的:扩增并克隆耐拉米夫定乙型肝炎病毒(HBV)变异株全基因组DNA,为构建含双体HBV YMDD DNA质粒和HBV YMDD变异株细胞模型及研究药物筛选奠定基础.方法:从一名耐拉米夫定的慢性乙型肝炎病人血清中提取HBV病毒DNA,用错配PCR结合限制性片段长度多态性(RFLP)进行变异分析,然后采用PCR方法在HBV负链开环缺口处及基因组中单一酶切点(Spe Ⅰ)处,设计两对引物从两个方向分别扩增1.15 kb和2.05 kb的单链及双链DNA区,利用基因重组技术,将两片连接后克隆至质粒pcDNA3.1-中,再进行DNA序列测定.结果:错配PCR结合RFLP分析证实该病毒存在YVDD变异,通过两段法克隆出HBV全基因组,经序列分析所得为HBV YMDD变异株全基因组.结论:成功克隆出HBV YMDD变异株全基因组.

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