吴佩衡先生精于寒热辨证,在长期的教学与临床经验中总结了自己独特的中医思维方式,善用附子、桂枝治疗各种伴随疼痛的疾病,如以温经散寒、祛风除湿治疗痹证;以温肾助阳、行瘀通络治疗脉痹;以温阳散寒、利湿排石治疗石淋;以温经散寒、活络通乳治疗乳痈等,临床疗效果显著,同时为后世医家辨别“阳虚阴寒”证的疾病,留下宝贵的临证经验。