牦牛瘤胃元基因组文库中木聚糖酶基因的分析

作者：王敏; 陈富荣; 张山; 朱雅新; 东秀珠; 黄力; 田瑞华; 董志扬; 戴欣

来源：微生物学报, 2011, 51(10): 1364-1373.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2011.10.007

• 牦牛瘤胃
• 细菌人工染色体(BAC)文库
• 木聚糖酶
• 木糖苷酶
• 协同作用 yak rumen
• bacterial artificial chromosome(BAC) clone library
• xylanase
• xylosidase
• synergistic effect

【目的】了解牦牛瘤胃微生物木聚糖酶多样性及其降解特征,为木聚糖降解提供新的基因资源。【方法】根据对已构建的瘤胃微生物元基因组细菌人工染色体(BAC)克隆文库高通量测序结果的注释,筛选其中编码木聚糖酶的基因并进行多样性分析;对其中一个木聚糖酶基因及其连锁的木糖苷酶基因进行克隆表达和酶学性质表征,分析其协同作用。【结果】共筛选到14个木聚糖酶基因,均编码GH10家族木聚糖酶,其氨基酸序列之间的相似性为20.5%-91.3%;其中7个木聚糖酶基因所在的不同的DNA片段(contig)上存在木糖苷酶基因,编码的木糖苷酶属于GH43或GH3糖苷水解酶家族。将其中一对连锁的木聚糖酶(Xyn32)和木糖苷酶...

• 单位
  生命科学学院; 内蒙古工业大学; 中国科学院微生物研究所; 微生物资源前期开发国家重点实验室; 内蒙古农业大学