摘要
目的 探索miR-362差异表达对急性髓系白血病(AML)患者预后的影响及潜在机制。方法 从TCGA在线数据网站(http://www.linkedomics.org)下载AML患者数据集,将miR-362表达水平大于中位数的患者设为高表达组(n=81),将miR-362表达水平小于中位数的患者设为低表达组(n=81),绘制两组患者生存曲线。将所检测的RNA表达水平逐一与miR-362表达水平进行Pearson相关性分析,分别筛选出与miR-362表达相关系数最高的正、负相关基因各50个,进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和相互作用网络分析,筛选关键基因。另选取2021年11月至2022年11月在我院进行治疗的AML患者76例,分为miR-362高表达组和低表达组,留取外周血标本,实时荧光定量PCR检测DNMT3A和ITGAM基因表达水平,比较两组患者临床年龄、预后及基因表达等指标。结果 miR-362高表达组患者年龄高于低表达组,差异有统计学意义(56.5±16.2岁vs 51.2±16.0岁,P<0.05)。miR-362高表达组患者的中位生存时间少于miR-362低表达组,差异有统计学意义(275d vs 577d,P<0.05)。共检测到6 465个基因与miR-362表达具有相关性(FDR<0.05),包括3 198个基因呈正相关,3 267个基因呈负相关。富集分析结果提示相关基因主要富集的生物学进程为生物学调节、代谢调节和应激反应;主要富集的细胞组分为膜、囊泡和内膜系统;主要富集的分子功能是蛋白结合、铁结合和分子转录活性。KEGG富集分析提示,相关基因主要富集的信号通路为泛酸与CoA生物合成通路、矿物质吸收通路和P53信号通路。通过互作网络图可见,DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3A(DNMT3A)和整合素α-Μ(ITGAM)处于网络核心位置,可能是影响AML患者预后的关键基因。高表达组患者年龄大于低表达组(P<0.05);高表达组预后不良患者比例高于低表达组(P<0.05)。与低表达组比较,高表达组DNMT3A基因表达水平降低,ITGAM基因表达水平升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 miR-362高表达与AML患者生存率降低相关,miR-362表达升高后可能通过影响泛酸与辅酶A生物合成通路及DNMT3A和ITGAM等基因表达,影响AML的病情进展。
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单位解放军总医院