作为蛋白质组支柱技术的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱可直接将样品点靶,生成微生物的蛋白质指纹图谱与数据库中的相关数据比对匹配后,由相关软件给出鉴定结果。本文围绕样品处理方式、谱图数据处理、谱图格式等,介绍蛋白质指纹图谱数据的解析与应用。通过构建标准化的食品微生物蛋白质指纹图谱数据库,并实现数据库资源及时有效的扩充,能为我国食品微生物快速检测提供良好的技术支撑平台。