乙醛脱氢酶2基因的可变剪接分析

作者：夏万松; 夏英; 韦四喜; 周春欢; 杜洪; 袁婷; 金泳; 黄海

来源：贵州医科大学学报, 2021, 46(01): 22-26+31.

DOI：10.19367/j.cnki.2096-8388.2021.01.004

• 胃肿瘤
• 胃肿瘤细胞
• 乙醛脱氢酶2
• 可变剪接
• 变异体
• 开放阅读框

目的探讨胃癌细胞中的乙醛脱氢酶2(ALDH2) mRNA发生可变剪接。方法设计ALDH2基因特异性引物,用胃癌细胞(AGS、HGC-27、MKN45)、正常人胃黏膜上皮细胞GES-1和人外周全血白细胞提取RNA,进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,然后对ALDH2扩增产物进行测序分析;使用DNAStar软件分析ALDH2变异体(V)的开放阅读框(ORF)。结果 ALDH2变异体1(V1)外显子2和外显子4发生可变剪接,V1外显子1的3'端和外显子3的5'端3个不同的位点发生可变剪接,V1存在8个长度超过100氨基酸的ORF。结论 ALDH2 m RNA存在多种可变剪接形式,提示其存在复杂的蛋白表达功能。

• 单位
  贵州中医药大学; 贵州医科大学; 贵航贵阳医院; 第一附属医院检验科