CISI2.0：更好的抗体交叉或自身相互作用预测工具

作者：周雨薇; 岳鹏; 黄健^*

来源：电子科技大学学报, 2021, 50(05): 659-657.

• 交叉相互作用
• 可开发性
• 自身相互作用
• 支持向量机
• 治疗性抗体

抗体广泛用于各类疾病的预防、诊断与治疗。然而,治疗性抗体研发的成功率还不尽人意。不少抗体因为稳定性差,溶解度低,存在交叉或自身相互作用等可开发性缺陷而最终开发失败。候选单克隆抗体能否开发成功,与其理化性质息息相关。虽然已有多种实验方法测定抗体交叉或自身相互作用相关的多种理化特性,但实验测试费力费时费钱。现有的抗体可开发性计算方法,或者依赖于结构,速度慢,通量低;或者未提供可用的软件或在线服务;或者提供的计算服务或软件费用过高;或者预测器的性能与健壮性有待提高。该文仅基于抗体序列,采用二肽期望均值偏差为特征,构建预测抗体交叉或自身相互作用的支持向量机模型。评估结果显示,该集成模型敏感性为100%,准确率为96.18%,可望用于抗体交叉或自身相互作用的高通量评估,加速治疗性抗体研发进程,降低研发成本。

• 单位
  电子科技大学; 成都东软学院