草莓Metacaspase基因家族全基因组鉴定及表达分析

作者：郑益平; 陈坚; 朱炳耀^*

来源：福建农业学报, 2020, 35(11): 1188-1197.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2020.11.003

• 草莓
• metacaspase
• 细胞程序性死亡(PCD)
• 基因组
• 表达分析

【目的】精氨酸/赖氨酸特异性半胱氨酸酶(metacaspases, MCs)在植物生长发育的细胞程序性死亡(programmed cell death,PCD)中发挥重要的调控作用,为系统鉴定草莓FaMC基因家族,进行草莓FaMC基因家族全基因组鉴定及表达分析。【方法】通过草莓全基因组数据分析FaMC蛋白的理化性质、结构域、系统发育关系和保守基序,采用qRT-PCR技术对草莓6个组织器官和6个果实发育时期中的FaMC基因进行表达分析。【结果】蛋白序列分析表明,草莓基因组中21个FaMC成员分为3种类型:Ⅰ型、Ⅰ*型和Ⅱ型。系统发育树和保守结构域分析表明:Ⅰ型FaMC含N端前结构域且包含1个锌指结构;Ⅰ*型FaMC含N端前结构域,但其中没有锌指结构;Ⅱ型FaMC不含N端前结构域。基因表达分析发现,FaMC基因在不同组织中存在表达差异性,Ⅰ型、Ⅰ*型和Ⅱ型FaMC基因分别在叶片、根和花中高表达。在果实发育过程中,多数Ⅰ*型FaMC基因的表达水平呈现出高-低-高的动态变化趋势;部分Ⅰ型、Ⅱ型FaMC在果实发育过程中呈现相反的表达模式。【结论】FaMC基因可能在草莓生长过程中发挥重要作用。

• 单位
  福建省农业科学院