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摘要
组蛋白去甲基化酶（histone demethylase，HDM）是生物生长过程中的重要调节因子之一，在植物的生长发育和环境适应过程中发挥着重要的调控作用。本研究通过生物信息学方法对甜瓜（Cucumis melo L.）HDM基因家族进行了鉴定，并通过转录组数据检测了其成员在甜瓜组织的表达特性。结果显示，在甜瓜基因组中鉴定得到了20个CmHDM基因，在各条染色体上非均匀分布；其成员可以分成LSD1和JmjC两大类，而JmjC类群又可划分为5个亚群，各类群成员数量不等；种内和种间的共线性关系显示，甜瓜HDM基因仅存在一对片段重复，与番茄（Solanum lycopersicum）HDM基因共线性区域较多，亲缘关系较近；各成员所含保守结构域数量不等，且外显子和内含子在数量上有所差异；在启动子区域存在多种与激素和环境信号响应的顺式作用元件，表达特性分析显示各基因成员在甜瓜雄花、雌花、根、茎、叶、子房和成熟果实中均存在不同程度的表达。这些结果将有助于更好地理解HDM基因的潜在功能以及它们在参与调节甜瓜生长发育和环境自适中可能发挥的作用。
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单位生命科学学院; 内蒙古大学
