白菜品种的SSR指纹图谱数据库的构建

作者：张婉; 崔继哲; 于拴仓; 李丽

来源：分子植物育种, 2013, (06): 843-857.

• 白菜(Brassica campestris L.ssp.Pekinensis)
• SSR
• 核心引物
• 指纹图谱
• 数据库 Chinese cabbage(Brassica campestris L.ssp.Pekinensis)
• SSR
• Core primer
• Fingerprint
• Database

本研究利用SSR标记技术筛选出合适的核心引物,对70个白菜品种进行DNA指纹分析,构建白菜SSR指纹图谱数据库。首先从500对引物中筛选出80对具有多态性的引物,再从其中选取20对多态性高,稳定性好且均匀分布在白菜10条染色体上的核心引物进行PCR扩增,引物多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均为0.716,变化范围0.473~0.932,平均杂合率0.504 4。经PCR电泳检测统计得到的指纹图谱进行综合分析,形成各个白菜品种的SSR指纹代码,并且采用ClusterProject对构建的指纹图谱数据进行分析整理,得到各品种的指纹模式图谱,...

• 单位
  哈尔滨师范大学; 北京市农林科学院蔬菜研究中心