白腹鼠属种间基因流对物种形成的影响

作者：武新来; 温知新; 程继龙; 夏霖; 杨奇森; 葛德燕

来源：第十六届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会, 中国湖北宜昌, 2023-08-26.

DOI：10.26914/c.cnkihy.2023.053103

• 白腹鼠属
• 物种形成
• 基因流
• 全基因组重测序
• 系统发育基因组学

物种形成背后的潜在的遗传机制一直是进化生物学热点话题之一。然而,物种形成是否会伴随着基因流是遗传学的一个核心问题。白腹鼠属(Niviventer;J.T.Marshall, 1976)起源于青藏高原东南缘,是南亚、东南亚至中国北方的特有种。根据形态以及分子鉴定,目前该属约有23个种,其中有18个种在中国均有分布。自中新世晚期以来,这些物种表现出快速的物种形成。在本研究中,我们对白腹鼠属16个物种93个个体的基因组进行重测序和分析。分别基于全基因组SNP数据和线粒体基因组构建最大似然树,树形结构并不完全一致,尤其是在华南社鼠(N. lotipes)的系统发育位置上,两者存在冲突。基因流分析表明短尾社鼠(N.bukit)分别与北社鼠(N.confucianus)与华南社鼠存在显著的基因流,后续分析证明这两次基因流是由于北社鼠与华南社鼠的共同祖先与短尾社鼠杂交造成的。此外,由北社鼠与华南社鼠共同祖先向短尾社鼠渗入的有关神经发育与系统发育的相关基因可能促进了短尾社鼠对环境的适应。最后,种群历史动态分析表明整个白腹鼠属受末次冰期影响严重,整个属在末次冰期种群剧烈收缩,且湄公针毛鼠(N. mekongsi)与缅甸社鼠(N. tenaster)存在明显的竞争关系,存在此消彼长的种群历史动态。本研究的目的是通过大规模的基因组数据,探究了白腹鼠属种间基因流对物种形成的影响,以及这些物种的种群历史动态。

• 单位
  中国科学院动物研究所; 河北大学; 生命科学学院