采用半巢式PCR技术从临床标本中克隆人类博卡病毒的全基因

作者:何涛君; 王琼; 何英; 黄烈; 张银辉; 林广裕; 陆学东
来源:国际检验医学杂志, 2014, 35(01): 3-5.
DOI:10.3969/j.issn.1673-4130.2014.01.002

摘要

目的为了对广东地区流行的人类博卡病毒生物学特性有更加全面的认识,克隆得到人类博卡病毒全基因,并与国际流行株进行比对。方法采用半巢式PCR分子生物学技术直接从临床呼吸道标本筛查确认人类博卡病毒感染阳性标本中,结合博卡病毒的全基因的生物信息学特点,设计6条特异性引物可配对成5对,通过3轮半巢式PCR方法特异性扩增人类博卡病毒的全基因序列。再将其定向连接到克隆载体中后进行测序,然后向GenBank提交克隆的人类博卡病毒的全基因序列,最后并对人类博卡病毒全基因的生物信息学分析。结果成功克隆并向GenBank提交了3株人类博卡病毒全基因序列,登录号分别为GQ926981、GQ926982和GQ926983。3株人类博卡病毒全基因序列与GenBank里的序列比对,高度同源性达98%以上,均属于人类博卡病毒HBoV1型。结论广东地区流行的人类博卡病毒基因与国际流行株基因比对无大的变异,可为人类博卡病毒相关蛋白的表达工作奠定基础。

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