波罗蜜叶绿素缺失突变体次生生长茎抗病基因的筛选

作者：郑李婷; 于旭东; 蔡泽坪^*; 罗佳佳; 吴繁花; 董俊娜; 谢柳青

来源：分子植物育种, 2020, 18(22): 7348-7355.

DOI：10.13271/j.mpb.018.007348

• 波罗蜜(Artocarpus heterophyllus)
• 叶绿素缺失突变体
• 次生生长茎
• 抗病基因

为研究波罗蜜叶绿素缺失突变体(CDM)次生生长茎中抗病基因(PRGs)的变化,从转录组数据中筛选出9 630个PRGs。去除低丰度(FPKM≤0.5)后进行差异表达基因(DEGs)筛选,将2 513个DEGs进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),寻找到2个与表型关联性较高的模块,共183个DEGs。对模块基因进行GO功能注释、分类、转录因子(TFs)及类受体蛋白激酶(RLKs)分析。结果显示,模块基因主要注释在结合(Binding)、细胞过程(Cellular process)和催化活性(Catalytic activity)等功能组。TFs分析显示,共有7个家族,14个转录因子。RLKs分析发现,RLK-Pelle-DLSV亚家族的12个DEGs中有11个在CDM中上调表达,说明该亚家族在波罗蜜CDM次生生长茎抵御逆境侵害过程中发挥着重要作用。本研究运用转录组测序数据分析波罗蜜CDM次生生长茎中PRGs的变化,为光合作用对木本植物茎响应逆境胁迫的研究提供数据。

• 单位
  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所; 海南大学; 农业部