地黄烯醇化酶基因(RgENO)的生物信息学与表达分析

作者：张丹丹; 苑璐; 邵露营; 朱佳琳; 周延清^*

来源：贵州农业科学, 2021, 49(01): 107-111.

DOI：10.3969/j.issn.1001-3601.2021.01.019

• 地黄
• 烯醇化酶基因
• 生物信息学分析
• 基因表达

【目的】研究地黄烯醇化酶基因(RgENO)的生物信息学功能及其表达情况。【方法】利用高通量测序对混合地黄发育块根进行转录组测序,通过基因注释得到地黄烯醇化酶基因(RgENO)序列,RgENO为780bp,编码260个氨基酸的蛋白质。利用生物信息分析软件对RgENO进行同源性比对、结构、跨膜结构区和信号肽分析;用RT-qPCR检测其空间表达。【结果】RgENO蛋白质相对分子量为27.7Kda,理论等电点pI为7.69,具有烯醇化酶典型的C端与N端双结构域,属于TIM磷酸结合超家族,不具有跨膜结构和信号肽,与芝麻的烯醇化酶相似度约为98%;RgENO在地黄的根、茎和叶中均有表达,但差异不明显。【结论】RgENO的编码蛋白质与芝麻的烯醇化酶相似度最高,约为98%;其在地黄根、茎和叶中均有表达。

• 单位
  生命科学学院; 河南师范大学