基于美味猕猴桃转录组的SSR特征分析

作者：郑世茂; 周希希; 贺乔乔; 张羽

来源：分子植物育种, 2022, 1-13.

• 美味猕猴桃（Actinidia chinensis var. deliciosa）
• 转录组
• SSR
• 序列特征

为了全面了解美味猕猴桃（Actinidia chinensis var. deliciosa）转录组中简单重复序列SSR的分布特点，充分开发SSR分子标记用于实践，本研究对美味猕猴桃叶片进行转录组测序，对经组装与联合去冗余后的Unigene进行SSR位点分析与引物设计。结果表明，美味猕猴桃转录组共获得97 426条Unigene，总长124 159 137 bp，搜索得到52 813个SSR位点，发生频率39.00%。在所有SSR位点之中有172种重复类型，以二核苷酸（57.31%）和单核苷酸（31.37%）重复类型为主，其中A/T类型和AG/CT类型SSR位点数占SSR总数的78.30%。SSR重复次数范围为5～73次，其中以5～12 （82.01%）次为主。SSR重复序列长度范围10～73 bp，平均长度为17.10 bp。针对所有SSR位点，共设计出37 173对引物，成功率为70.39%。该研究可为美味猕猴桃种质资源的挖掘与保护、优良品种选育和数量性状基因座定位提供参考。

• 单位
  陕西理工大学