应用高代育种株系中的剩余遗传变异定位水稻抽穗期QTL qHd5和qHd10

作者：王凌志; 张宏伟; 谢英; 郝留根; 王珍珍; 易崇粉; 郭慧; 甘雨; 向关伦; 杨占烈

来源：分子植物育种, 2022, 1-13.

• 水稻
• 剩余遗传变异
• 抽穗期
• 数量性状基因座

为了研究应用育种群体中的剩余遗传变异开展QTL定位的可行性，本研究利用高代育种株系大粒香/Mizuhotigara中的剩余遗传变异，采用QTL-seq对水稻抽穗期QTL进行检测，利用连锁分析对检测到的QTL进行验证。育种组合大粒香/Mizuhotigara的F_(5)选种圃中的株系G1140的抽穗期表现为连续双峰分布，推测该株系内可能存在主效抽穗期基因的等位变异。从株系G1140中挑选4个单株分别自交得到4套F_(6)群体，其中群体H2的抽穗期表现为连续的双峰分布。利用H2群体中抽穗极早和极晚单株的DNA分别构建DNA混池，采用QTL-seq进行抽穗期QTL定位，在第5染色体0～4.95 Mb和第10染色体16.64～18.27 Mb区间各检测到1个QTL，分别命名为qHd5和qHd10。利用H2群体采用连锁分析法对qHd5和qHd10进行验证，qHd5的加性效应为2.3 d，增效等位基因来自‘大粒香’，贡献率为4.2%；qHd10的加性效应为3.3 d，增效等位基因来自‘Mizuhotigara’贡献率为10.7%。本研究的结果为作物QTL定位提供了新的思路。

• 单位
  贵州省农业科学院水稻研究所; 贵州大学; 生命学院