加系大白猪乳头数性状的全基因组关联分析

作者：周佳伟; 张宇; 吴俊静; 乔木; 徐忠; 李梓芃; 杨前平; 彭先文; 梅书棋^*

来源：中国畜牧杂志, 2022, 58(08): 141-146.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220615-16

• 猪
• 乳头数
• 全基因组关联分析
• SNP

乳头数是母猪重要繁殖性状，影响断奶仔猪存活率。研究者对不同品种和品系的猪相继开展了乳头数性状相关数量性状座位(Quantitative Trait Locus,QTL)鉴定，但目前关于加系大白猪乳头数性状相关QTL的研究较少。本研究以944头加系大白猪群体为研究对象，对乳头数性状进行全基因组关联分析(GWAS)。GCTA软件计算左、右、总乳头数性状的遗传力分别为0.1、0.12、0.16。利用rMVP软件在SSC7上分别检测到4、1、4个与左、右和总乳头数基因组水平显著相关(P<1.26×10-6)的SNP，其中1个SNP位于SSC7的14.1 Mb，剩余3个SNP位于SSC7的97.6～102.0 Mb。在SSC3、SSC4、SSC6、SSC7、SSC9、SSC11、SSC13上分别鉴定到4、1、4、5、1、1、5个与乳头数性状潜在显著相关(P<2.52×10-5)的SNP。进一步扫描25个显著相关SNP上下游200 kb位置处的基因，共获得84个候选基因，其中SSC7上获得39个候选基因，包括FAM71D、MPP5、EIF2S1、PIGH、ARG2、RDH11、RDH12、VRTN、SYNDIG1L等候选基因。本研究为猪乳头数的选育提供了新的分子标记和候选基因。

• 单位
  湖北省农业科学院畜牧兽医研究所