基于SSR标记的高原粳稻品种遗传多样性分析

作者：陈于敏; 世荣; 刘吉新; 陈远伟; 陈玲; 张其钢; 郑晔; 刘慰华; 赵国珍^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(12): 4102-4111.

DOI：10.13271/j.mpb.017.004102

• SSR标记
• 高原粳稻
• 推广品种
• 遗传多样性

利用中国农业行业标准(NY/T 1433-2014)推荐的48对SSR引物,对81个高原常规粳稻推广品种进行遗传多样性分析。结果表明:37对SSR引物在81个品种间具有多态性,共检测到139个等位基因(分子量变异范围为89～288 bp),每对引物检测到的等位基因数(Na)为2～10个,平均3.76个。Nei基因多样性指数(He)为0.025～0.769,平均为0.438。SSR多态信息量(PIC)分布范围为0.024～0.727,平均为0.416。遗传相似系数变幅为0.42～1.0,平均为0.65。2007-2016年育成的品种遗传多样性低于2007年前育成的品种,两个时期育成的品种有15个SSR位点的等位基因存在差异。聚类分析表明,遗传相似系数为0.62时,81个品种划分为4个类群,其中第Ⅰ类、第Ⅱ类和第Ⅲ类分别包括4个、5个和12个品种,第Ⅳ类包括60个品种,占供试品种数的74.1%。表明大多数品种间遗传距离近,遗传基础较窄。在今后的水稻育种中,应加强有利基因发掘、引进和创新利用,以拓宽高原粳稻的遗传基础。

• 单位
  云南省农业科学院粮食作物研究所