基于RNA-Seq技术探讨肝失疏泄状态人群的转录组学特征

作者:田蕾; 吴昊; 韦昱; 柳金英; 郑敏; 何磊; 王伟; 郭淑贞; 赵燕*
来源:中华中医药杂志, 2019, 34(05): 2083-2088.

摘要

目的 :基于RNA-Seq技术分析肝失疏泄人群的差异表达基因,从转录组水平进一步揭示"肝主疏泄"的分子机制。方法:本研究基于中医有关"肝气郁结"的表现特征,并引入现代心理学中定义为负性情绪体验的神经质人格的概念及评判标准,筛选肝失疏泄人群,通过Hiseq2000 RNA-Seq技术进行测序,分析筛选与肝主疏泄组相比,肝失疏泄人群的显著差异表达基因。然后对两组的差异基因进行GO功能的显著性富集分析以及KEGG通路的显著性富集分析。结果:肝失疏泄人群与肝主疏泄组相比有55个显著差异基因,其中上调基因有35个,下调基因有20个。GO功能显著性富集分析结果显示,这些差异表达基因与防御反应、细胞吞噬、免疫球蛋白黏附等功能密切相关。KEGG通路显著富集分析结果表明这些基因与系统性红斑狼疮疾病的发病机制关系密切。其中FCGR1C、FCGR1B、LCN2与IL-10四个差异基因差异倍数较高且上述通路上均显著富集。结论:"肝主疏泄"的内在分子机制与机体的免疫系统功能密切相关,并进一步推测其功能是通过调控上述差异基因的功能来实现的。