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摘要
【目的】解析草菇多酚氧化酶基因家族序列信息,明确其特征和表达模式。【方法】通过转录组测序找出含有酪氨酸酶结构域的基因,并根据搜索得到的序列设计引物,以不同发育时期的草菇v26菌株,以及草菇蛋形期外菌膜、菌盖、菌柄等不同组织为材料提取RNA,经反转录为cDNA,扩增获得草菇多酚氧化酶基因序列。采用在线生物信息学网站预测草菇多酚氧化酶的理化性质。采用RT-PCR的方法,检测草菇不同发育时期和不同组织部位多酚氧化酶的表达模式。【结果】获得4个草菇多酚氧化酶基因家族的CDS 序列,依次命名为VvPPO1、VvPPO2、VvPPO3、VvPPO4,其中VvPPO1 CDS全长1 596 bp、编码531个氨基酸,VvPPO2 CDS全长2 685 bp、编码894个氨基酸,VvPPO3 CDS全长1 593 bp、编码530个氨基酸,VvPPO4 CDS全长2 067 bp、编码688个氨基酸。生物信息学分析表明,4个基因编码的蛋白均含有2个铜离子结合区,为亲水性蛋白;RT-PCR结果显示,4个基因在草菇发育的菌丝期、原基期、蛋形期、成熟期均有表达,VvPPO1、VvPPO3和VvPPO4的表达量在子实体时期高于菌丝期,在蛋形期VvPPO1和VvPPO4在外菌膜的表达量比在菌柄和菌盖中的表达量高。【结论】在草菇中搜索得到4个多酚氧化酶基因,均含有2个铜离子结合区,4个基因在各个发育时期均有表达。
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单位广东省农业科学院蔬菜研究所; 广东省现代农业装备研究所; 广东省蔬菜新技术研究重点实验室
