内质网应激通路相关蛋白IRE1、PERK、ATF6在舌鳞癌中的表达及其功能的生物信息学分析

作者：张勇涛; 李霞; 李晓齐; 买丽亚木古丽·阿布都克尤木; 张贵程; 齐鲁^*

来源：生物化工, 2023, 9(05): 1-18.

• 舌鳞癌
• 肌醇需求酶1(IRE1)
• 蛋白激酶R样内质网激酶(PERK)
• 激活转录因子6(ATF6)
• 生物信息学

目的：本研究旨在通过生物信息学方法系统分析肌醇需求酶1(Inositol-Requiring Enzyme 1,IRE1)、蛋白激酶R样内质网激酶（Protein Kinase R-like Endoplasmic Reticulum Kinase,PERK）、激活转录因子6(Activating Transcription Factor 6,ATF6)在舌鳞癌中的表达及意义。方法：使用GEO、Kaplan-Meier Plotter、GeneMANIA、DAVID等多个数据库对IRE1、PERK、ATF6在舌鳞癌中的表达与预后价值、相互蛋白作用网络及功能富集进行综合分析。结果：ATF6在舌鳞癌组织中表达高于癌旁正常组织，差异具有统计学意义（P <0.05）。IRE1及PERK高表达组患者总生存率（OS）高于低表达组，ATF6高表达组患者OS低于低表达组，差异均具有统计学意义（P <0.05）。本研究筛选出与IRE1、PERK、ATF6相互作用的蛋白质各20个并进行GO富集分析。IRE1及相关蛋白富集于内质网、线粒体等细胞组分中，具有蛋白质结合、蛋白磷酸酶结合等分子功能，参与内质网应激反应、泛素依赖性ERAD途径等生物学过程。PERK及相关蛋白富集于胞液、细胞膜等细胞组分中，具有翻译起始因子活性、RNA结合等分子功能，参与内质网未折叠蛋白反应、细胞对葡萄糖饥饿的反应等生物学过程。ATF6及其相关蛋白富集于内质网、细胞核等细胞组分中，具有转录调控区序列特异性DNA结合、蛋白质异二聚化活性等分子功能，参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、内质网未折叠蛋白反应等生物学过程。结论：ATF6在舌鳞癌组织中呈现高表达，同IRE1、PERK与舌鳞癌患者不良预后相关。在未来抗肿瘤治疗中，IRE1、PERK、ATF6可能成为舌鳞癌的诊断和治疗的新选择。

• 单位
  第二临床医学院; 新疆医科大学