全基因组挖掘与分析类芽孢杆菌SSG-1的甘露聚糖水解酶

作者：彭婕; 乔晋楠; 李文馨; 张义阳; 张山; 乔代蓉; 曹毅^*

来源：应用与环境生物学报, 2021, 27(06): 1441-1447.

DOI：10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.07066

• 类芽孢杆菌
• 甘露聚糖酶
• 基因组
• 生物信息分析

甘露聚糖(mannan)是半纤维素中含量仅次于木聚糖的难水解多糖,发掘将甘露聚糖水解为甘露寡糖的甘露聚糖降解酶,对实现其在生物能源、制药、食品、饲料、制浆造纸和纺织等领域的应用,具有极其重要的意义.类芽孢杆菌是甘露聚糖水解酶的新酶源,但鲜见产甘露聚糖酶的报道.利用从土壤中分离获得的产琼胶酶类芽孢杆菌SSG-1的全基因组数据,采用生物信息技术,从全基因组角度挖掘其甘露聚糖水解酶.共挖掘获得6条甘露聚糖水解酶,经Pfam、CDD和分子进化分析,WP089548806.1为GH26家族的内切β-1,4-甘露聚糖酶,WP089549173.1和WP089548729.1为GH76家族的α-1,6-甘露聚糖酶,WP089547966.1、WP089548481.1和WP009225474.1为GH2家族的β-甘露糖苷酶.其中,WP089548806.1和WP089548729.1为分泌蛋白,多序列比对和结构分析表明WP089548806.1具有内切β-1,4-甘露聚糖酶保守的底物结合和活性位点,具有β-甘露聚糖酶典型的(β/α)8-TIM桶状结构.本研究成功从类芽孢杆菌SSG-1中挖掘出6个新型甘露聚糖水解酶,可为挖掘新型甘露聚糖水解酶资源以及揭示类芽孢杆菌SSG-1甘露聚糖酶的表达调控机制奠定重要基础.(图4表7参19)

• 单位
  生命科学学院; 四川大学; 成都生物制品研究所有限责任公司