2015-2018年上海市环境污水中非脊髓灰质炎肠道病毒的分布及柯萨奇病毒B5的分子特征

作者：李云逸; 陆菁; 杨玉颖; 费洁; 张莉萍; 李智; 胡家瑜; 李崇山^*

来源：疾病监测, 2019, 34(12): 1089-1095.

• 非脊髓灰质炎肠道病毒
• 环境污水
• 柯萨奇病毒B5

目的分析2015—2018年上海市闵行区和嘉定区环境污水监测中非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)的分布特征,探讨环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹(AFP)病例监测中柯萨奇病毒B组5型(Cox B5)分离株之间的关系和变迁规律。方法选择上海市闵行区和嘉定区污水处理厂作为长期固定监测点,每月采集监测点的污水进行浓缩富集,取上清液并接种于人横纹肌肉瘤细胞(RD)和人喉癌上皮细胞(Hep-2)进行病毒分离。通过反转录–聚合酶链式反应(RT-PCR)获得VP1区序列并进行分析。结果 2015—2018年共采集污水样本84份,共分离242株NPEV,包含19个基因型,Cox B5为比例较高的基因型,占18.18%(44/242)。2015—2018年,环境污水、健康儿童和AFP病例监测中的Cox B5分离株形成2个基因型和3个传播链,即C3、C4和D3基因亚型。C3基因亚型在上海市属于优势基因亚型,而D3基因亚型是2016—2018年新出现的传播链。结论 2015—2018年上海市2个区环境污水中常见的优势基因型为ECHO11、Cox B5、Cox B3和ECHO6。Cox B5在环境污水、健康儿童和AFP病例中存在共循环现象。我国尚未建立完善的NPEV相关疾病监测系统,环境污水监测可作为病例监测的重要补充方法。

• 单位
  上海市疾病预防控制中心; 上海市闵行区疾病预防控制中心