犬Ⅰ型腺病毒E1A蛋白的生物信息学分析

作者：徐文悦; 廉士珍; 刘晓颖; 邓效禹; 胡博; 张蕾; 薛向红; 贾琳琳; 闫喜军; 朱言柱^*

来源：特产研究, 2020, 42(05): 34-40.

DOI：10.16720/j.cnki.tcyj.2020.05.006

• 犬Ⅰ型腺病毒
• 生物信息学分析
• E1A蛋白
• 磷酸化位点

为进一步了解犬Ⅰ型腺病毒,并深入探究E1A蛋白的基本结构,为CAdV-Ⅰ的研究奠定基础。该研究利用Protparam、ProtScale、SignalP 5.0 Server和TMHMM Server 2.0等在线服务器对E1A蛋白的理化性质、信号肽和二级及三级结构等进行预测。结果发现,E1A蛋白氨基酸数量为225个;等电点为11.86,带正电荷氨基酸残基数和带负电荷氨基酸残基数分别为36和2;E1A蛋白为有跨膜结构、疏水性蛋白、无信号肽、无糖基化位点、含有9个丝氨酸磷酸化位点,10个苏氨酸磷酸化位点,不存在酪氨酸磷酸化位点;-螺旋和无规则卷曲结构是E1A蛋白的二级结构中最主要的元件,可信度为19.0%,蛋白覆盖率为9%,有6个抗原决定簇。以上结果有利于进一步开展E1A蛋白的研究,为建立CAdV-Ⅰ的抗体检测方法和亚单位疫苗提供了基础。该研究运用生物信息学分析方法预测E1A蛋白,但生物信息学是在已有知识基础上的预测,所以未来还需要对此进行进一步研究探讨。

• 单位
  吉林农业大学; 中国农业科学院特产研究所