酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用的分子模拟研究

作者：陈沛全; 刘幸海; 孙宏伟; 王宝雷; 李正名; 赖城明

来源：Acta Chimica Sinica, 2007, (16): 1693-1701.

• 酮醇酸还原异构酶(KARI)
• 抑制剂
• Possion-Boltzmann方程
• 分子对接
• 密度泛函理论 ketol-acid reductoisomerase(KARI)
• inhibitor
• Possion-Boltzmann equation
• molecular dock-ing
• density functional theory

采用MCCE,Autodock及密度泛函方法对酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用进行了研究.计算结果表明,KARI活性位点中的Mg2+在活性位点残基的离子化状态、活性位点的静电性质以及与抑制剂结合等方面起重要的作用;同时,抑制剂在结合方式、前线轨道布居及静电势等方面与酶促反应中间体(HOIV)具有一定程度的相似性;可电离的羧基是当前发现的靶向KARI抑制剂一个重要的结构特征,进一步推广可认为潜在的抑制剂应该拥有可电离成负电荷的功能团.在药物设计中考虑到以上结论,将有利于发现和改造靶向KARI的抑制剂.

• 单位
  元素有机化学国家重点实验室; 南开大学