菠萝基因组DNA快速有效抽提方法

作者:肖霄; 邹幸江; 崔世娇; 尚永才; 闭陆梅; 殷涛; 冯世鹏*
来源:分子植物育种, 2023, 1-17.

摘要

菠萝是全球第三大热带水果,深受广大消费者喜欢,基因组DNA抽提是菠萝品种鉴定、基因组变异分析等应用的基础。目前菠萝DNA抽提方法要么步骤繁琐要么价格较贵,为了找到一种快速有效的菠萝DNA抽提方法,本研究对目前植物基因组DNA抽提的8种方法或试剂盒在菠萝基因组DNA抽提上的应用进行了比较,发现本研究改进的CTAB法步骤少,将研磨好的菠萝组织材料通过CTAB裂解,再用氯仿去杂及乙醇沉淀清洗即可,该方法操作简单,耗时少,价格便宜,所抽提的DNA浓度高,虽然其含一定杂质,但不影响后续PCR及品种鉴定等应用。同时发现一种商业试剂盒(硅胶膜吸附法)用时较少,所抽提的DNA纯度较高,但是价格相对较贵。这两种方法可以互为补充,根据实验目的选择合适的方法进行菠萝DNA的抽提,这些结果为后续菠萝科研应用提供了基础。