奶牛CCL11基因启动子、外显子的扩增及多态性分析

作者：徐萍; 徐小博; 冯玉祥; FOTINATetiana; 王三虎; 赵坤^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (21): 81-154.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.03.0211

• 奶牛
• 乳腺炎
• CCL11基因
• 启动子
• 外显子
• 多态性分析

为了探讨CCL11基因启动子和外显子的多态性,试验采集88头中国荷斯坦奶牛的血液样品,通过PCR技术扩增了中国荷斯坦奶牛CCL11基因外显子和启动子序列;同时用限制性内切酶酶切的方法检测了中国荷斯坦奶牛CCL11基因外显子的多态性;酶切产物经琼脂糖凝胶电泳判断突变位点的基因型;通过ESEfinder 3.0在线软件预测差异位点基因序列可能存在的ESE基序;利用Expasy-Translate tool在线翻译软件将基因测序结果翻译成氨基酸序列。结果表明:试验成功扩增出中国荷斯坦奶牛CCL11基因启动子序列,第1段长度为794 bp,第2段长度为1 060 bp,经测序未检测出多态位点;3个外显子序列长度分别为524,539,1 130 bp,其中第2,3外显子经测序未检测出多态位点。在第1外显子80 bp处存在一个T>G的突变,且突变导致氨基酸序列由缬氨酸变为甘氨酸,为有义突变,突变与ESE基序之间存在着较强的相关性。CCL11基因有TT(野生型)、TG(杂合型)、GG(突变型)3种基因型,基因型频率分别为17.05%、75.00%和7.95%。说明奶牛CCL11基因的突变可能与奶牛乳腺炎的发生相关。

• 单位
  新乡学院; 河南科技学院; 动物科技学院