牛肉红朱橘抗氧化生物合成关键基因的表达特征

作者：李文云; 罗怿; 王小柯; 柏自琴; 林乾; 李金强^*

来源：贵州农业科学, 2022, 50(02): 63-69.

• 柑橘
• 牛肉红朱橘
• 抗氧化
• 差异表达基因
• 类胡萝卜素
• 苯丙烷

【目的】探明贵州地方特色柑橘种质牛肉红朱橘(NRH)抗氧化生物合成关键基因及表达特征，揭示其抗氧化生物活性的形成机理，为地方柑橘资源的开发利用提供依据。【方法】利用RNA-Seq技术对NRH及其亲本朱红橘(ZHJ)进行转录组测序分析。【结果】除去低质量数据后Clean reads数为(3.93～4.49)×107个，总净核苷酸数为(5.89～6.73)×109个；在阈值为|log2(FoldChange)|>0和padj<0.05时，共筛选到1 282个差异表达基因，其中上调833个，下调449个。GO功能富集分析共富集到9个差异类别。KEGG功能富集分析的代谢通路主要包括核糖体、淀粉和蔗糖代谢、类胡萝卜素生物合成、MAPK信号通路和苯丙烷生物合成等。【结论】鉴定出2条与抗氧化密切相关的代谢通路，即类胡萝卜素(7个差异基因)和苯丙烷生物合成途径(16个差异基因),其中17个基因在NRH中上调表达，6个下调表达。

• 单位
  贵州省农业科学院