肾透明细胞癌中基于坏死性凋亡相关基因构建的预后预测模型

作者：李雪祥; 李云雪; 程陆林; 刘春钰; 宋亚荣; 邢毅飞^*

来源：临床泌尿外科杂志, 2022, 37(04): 245-251.

DOI：10.13201/j.issn.1001-1420.2022.04.001

• 肾透明细胞癌
• 坏死性凋亡
• 预后模型
• 生物信息

目的:通过生物信息学的方法寻找肾透明细胞癌与坏死性凋亡有关的风险基因，并构建由基因组成的预后预测模型。方法:下载肿瘤基因组图谱(TCGA)中肾透明细胞癌数据集，分析癌与癌旁组织差异表达基因，鉴定出21个坏死性凋亡相关基因。对TCGA数据集进行最小绝对收缩和选择算法(LASSO)、Cox单因素及多因素回归分析，构建风险模型。通过Kaplan-Meier(K-M)生存曲线、ROC曲线检验、评估模型预测的准确性，E-MTAB-1980作为外部数据集进行验证。结果:通过筛选构建一个基于6基因风险评分模型，风险评分=-0.107 5×IFNAR1+0.316 1×SHARPIN+0.423 5×RBCK1+0.535 3×TNFRSF1A-0.282 9×TICAM1-0.211 8×TKFC。根据TCGA训练队列的结果，低危亚组的总生存期优于高危亚组(P<0.001)。外部验证集评估模型5年AUC值为0.770。并且风险预测模型可作为独立预后因素评价患者预后。结论:基于坏死性凋亡相关基因构建的风险评分模型是一种很有临床前景的预测指标，可用于区分肾透明细胞癌患者的预后。

• 单位
  华中科技大学同济医学院附属协和医院