湖北钉螺肝胰腺cDNA文库的构建和序列分析

作者：朱丹丹; 赵琴平; 聂品

来源：水生生物学报, 2011, (04): 672-680.

• 湖北钉螺
• 肝胰腺
• cDNA文库
• EST Oncomelania hupensis
• Hepatopancreas
• cDNA library
• Expressed sequence tag

以湖北钉螺肝胰腺为材料构建cDNA文库。文库初始滴度为5.6×104 cfu/mL,库容量为6.72×105 cfu/mL,重组率为93%。插入片段长度为400—2700 bp。对其中1728个克隆进行测序,得到1520个序列,其中长度大于100 bp的ESTs为1393条,初步拼接得到698个单基因簇(Unigene),其中包括234个重叠群(Contig),464个单拷贝(Singleton)EST。使用BLAST软件进行同源性分析,结果显示有111个单基因簇具有不同程度的同源性,约占15.90%;587个单基因簇与所有已发现的蛋白质的基因没有或者有着相当低的同源性,约占84.10%。研究...

• 单位
  武汉大学; 基础医学院; 中国科学院水生生物研究所; 淡水生态与生物技术国家重点实验室